Después de que S. Columba intentara convertir a los pictos del norte al cristianismo, los moradores de esta zona cambiaron su credo pagano por el cristiano y viceversa en varias ocasiones hasta que en el siglo XVII, S. Cumin visitó el valle. Siguió con la labor de S. Columba y estableció el cristianismo plenamente en esta parte de las Highlands.
Construyó una iglesia aquí y el pueblo empezó a conocerse como Cille Chuimein o Iglesia de Cumin. Los habitantes de la zona todavía lo llaman así y la escuela del pueblo se llama Kilcumen Academy. Después de que se diera el Levantamiento Jacobita de 1715 (los jacobitas apoyaban a la dinastía católica de los Estuardo), el General George Wade construyó una red de carreteras que tenía como centro Cille Chuimein.
También construyó un fuerte nuevo en este lugar al que dio el nombre de Fort Augustus en honor del hijo favorito del Rey Jorge, Guillermo Augustus, duque de Cumberland. El pueblo adoptó el nombre inglés de Fort Augustus en cuanto acabó de construirse. El fuerte era enorme y fue construido sólidamente con cuatro baluartes muy bien defendidos en cada una de sus esquinas. Alojaba a un destacamento militar considerable.
El último Levantamiento Jacobita se dio en 1745 y el fuerte se entregó a las fuerzas jacobitas que lo habían dañado seriamente con fuego de cañón. En 1746 los jacobitas fueron derrotados y el duque de Cumberland, el hombre que había dado nombre al fuerte, decidió utilizarlo como su cuartel general, aunque había pasado a ser inservible. A Cumberland le enfureció la destrucción del fuerte y cometió muchas atrocidades contra el pueblo de las Highlands. El fuerte no se volvió a construir después de 1745. Lord Lovat se lo compró al gobierno y reconstruyó uno de los edificios para ser usado como pabellón de caza. En 1878 se lo entregó a los monjes benedictinos que construyeron la abadía contigua a los cimientos del fuerte y a los edificios que quedaban en pie.
Los monjes lo utilizaron como internado hasta 1993 y como centro de visitantes hasta 1998, momento en el que era la atracción privada más visitada de Escocia. Hoy en día, estos bonitos edificios se han convertido en apartamentos y ya no están abiertos al público.